1、浸种处理
为了缩短种子发芽的时间，小番茄和其它通过播种繁殖的植物一样需要通过浸种来促进发芽。浸种时，将事先准备好的健康而饱满的种子放在55℃的温热水中浸泡一刻多钟，同时用工具不停搅动种子和水的混合物，等到温度降低到室内温度的时候停止搅动，然后静泡半天，等在种子发胀。
2、催芽过程
将经过浸种的种子平撒在事先准备好的纱布上，用喷水器喷水纱布，然后用纱布将种子包裹好放在25℃左右的阴凉通风环境中进行催芽。催芽过程应当在黑暗的环境中进行，所以需要提前做好遮蔽光线的准备。在这种条件下，通常1、2天之后种子就会萌芽。
3、配制营养液
在种植催芽的同时，我们可以在一旁制作水培营养液了。如上图所示，在容器中注入清水直到水位线的位置，如果是夏季，建议保持水平面在水位线一下1公分左右的位置。然后在加好水的容器中倒入适量的营养液，然后搅匀容器内水溶液。
4、浸泡海绵块
取一个海绵，将其切割成数个大小适中的小方块，然后放入水中，并在水中一捏一松反复几次，然后将其捏紧取出来晾在一旁。经多次捏过海绵块内的空气基本被排除来，取出来的海绵基本上还保持着湿润，但并没有积水。
5、种子播种
用镊子轻轻将催过芽的种子夹起来，再将其轻轻放入晾过的海绵块中，摆放时让芽朝上。按照同样的方法将剩余那些种子放入对应的海绵块中。接着将这些放有种子的海绵块置于种植篮底部，然后将种植篮隔孔放入叶菜板的圆孔中。再将遮光帽放入还没有种植的孔内，然后将浮标放入到先前容器的浮标孔里面。最后将整个叶菜板放置于容器中，将容器推进机器里面。
现在用两张a4大小的纸张覆盖在播好种子的叶菜板上以遮蔽光线，再将机器的门关好，这时我们就静待种子继续在黑暗的环境下发芽了。
6、育苗期管理
在种子生长发芽的过程中，我们要尽可能做好育苗所需要满足的所有条件。
（1）光照
等种子完全发芽后，先将a4大小的遮光纸拿开，然后按下机器上面的“叶菜生长”按键，为幼苗提供适宜的光照。
（2）营养液
幼苗在生长期内要及时更换和补充营养液，最多半个月就要补充1次营养液，1个月后需要更换全部溶液。
（3）植株管理
幼苗在生长过程中会逐渐萌发侧枝，但为了让幼苗生长得更好，萌发出更多健壮的枝叶来，这时需要将萌发的这些侧枝剪除；当幼株长大成型开花结果时，我们需要为植株摘心或打顶，同时我们需要适当摘除植株的腋芽，一方面可以阻止植株进一步长高，另一方面更利于果实长得壮硕。当果实成熟后，我们就可以进行采收了。